а разве полукровка уже не имеет измененный ген.

Любой ребенок имеет новый геном по сравнению с его родителями. Когда говорят о географических и/или национальных различиях в генах человеческой популяции, имеют ввиду не геном в целом, а различия в y-хромосомных гаплогруппах (соответственно кто кого насиловал или уводил в полон - значение имеет очень небольшое, существенное значение имеет только где постоянно живут мужчины). Если некий условный татаро-монгол носитель C3 набежал на поселение R1A1, мужиков какие не попрятались вырезал, а баб изнасиловал, то все его дети (кого за происхождение в реке не утопят) будут носителями C3. Гаплогруппы от ебли не смешиваются, а мутируют очень редко, потому их и используют для исследования миграций. Папа ускакал грабить-убивать, а дети остались, и их косые морды не очень-то радуют глаз аборигенов. Даже если кто выживет, шансы оставить потомство меньше, чем у голубоглазых автохтонов, зачатых за год до набега или на следующий год после. Без поселившихся на постоянной основе мужчин ростки С3 будут постоянно размываться в море местных жителей, при том что все соседи с запада, по сути все некочевые соседи, сплошные носители той же R1A1.
Плюс к тому далеко не все волны монгольских завоевателей скакали из Монголии, чем дальше, тем больше участвовали местные кочевники под руководством (чем дальше, тем больше номинальным) Чингизидов. А в Средней Азии кочевых арийцев носителей R1A1 хоть током бей.