В 1992 году, волею судеб и благодаря распаду империи под названием Союз Советских Социалистических Республик, «Факел» оказался среди лучших представителей российского футбола – в Высшей лиге чемпионата вновь образованной Российской Федерации.

Казалось бы, вот он шанс наконец прервать традиции «калифа на час» и закрепиться таки в высшем дивизионе. Но нет – опять осечка. Перед началом и в ходе этого сезона команду покинули практически все ведущие игроки, многие из которых затем стояли у истоков славы камышинского «Текстильщика». Честь Воронежа пришлось отстаивать игрокам и тренерам, призванным по «комсомольскому» набору из футбольного клуба «Буран», представлявшего тот самый Воронежский авиационный завод. Кто сказал, что история не развивается по спирали?

Именно в 1992 году состоялся дебют на профессиональной арене, ставшего в последствии культовым для Воронежа Тренера – Валерия Георгиевича Нененко.

В 1993 году «Факел» выступил неудовлетворительно во втором эшелоне российского футбола и транзитом из Высшей лиги переместился в лигу вторую.

Осенью того же года команду возглавил вернувшийся из Камышина Сергей Викторович Савченко.

В сезоне 1994 года огнеопасные просто выжгли свою зону второй лиги, демонстрируя остроатакующую игру как на домашнем стадионе, так и на полях соперника. В этом сезоне в составе команды блистали такие неординарные игроки, а теперь и тренеры, как Владимир Зинич, Игорь Ляхов и Евгений Борзыкин.

В 1995 году «Факел» взял небольшую передышку, заняв только 13-е место в первой лиге. Но уже на следующий год, укрепив свой состав такими мастерами как Валерий Городов, Олег и Алексей Морозовы, Андрей Юдин и Михаил Зубчук, воронежцы завоевывают третье место в турнире и получают право выступать в высшем свете отечественного футбола.

Однако под солнцем «Факелу» вновь не удалось закрепиться. Сезон 1998 года ничем примечательным не запомнился – 10-е место в первой лиге. Надо было что-то менять.

В 1999 году к руководству клубом пришли Юрий Михайлович Батищев и Григорий Владимирович Чуйко, на должность главного тренера команды был возвращен Валерий Георгиевич Нененко. И команда ожила. По итогам сезона «Факел» занял второе место и вернулся в Высшую лигу. Лучшим игроком первой лиги был признан полузащитник воронежцев Геннадий Семин.

В следующий сезон команда вошла уверенной в своих силах и с твердым намерением прервать печальную традицию неудачника высшего света. Валерий Нененко громогласно объявил основные цели – обыграть московский «Спартак» и закрепиться в Высшей лиге. И «Факел» с честью выполнил поставленные задачи. Мяч, забитый с нулевого угла кумиром воронежских болельщиков – Виталием Сафроновым, на добавленных минутах в ворота московского «Динамо» стал истинным украшением того сезона.

Казалось бы, салюту над Центральным стадионом профсоюзов теперь греметь постоянно, а фирменному воронежскому суппорту трибун – газетным факелам, никогда не гаснуть. Но это только казалось. Вслед за триумфом, на воронежскую землю пришли «смутные времена»…